За біологічним значенням ферменти поділяють на метаболічні, травні та захисні.
Метаболічні ферменти — група ферментів, які каталізують анаболічні та катаболічні реакції у клітинах.
Метаболічні ферменти можуть міститися:
  • в гіалоплазмі — ферменти бродіння;
  • в ядрі — РНК-полімераза, ДНК-полімераза;
  • в мітохондріях — дегідрогенази та цитохроми дихального ланцюга;
  • на рибосомах — синтетази білків;
  • у хлоропластах — рибулозобіфосфаткарбоксилаза, або РуБісКо — фермент фіксації вуглекислого газу тощо.
У клітинах метаболічні перетворення субстратів здійснюються послідовно декількома ферментами. Кожний з цих ферментів каталізує певну ділянку загального метаболічного шляху. Сукупність ферментів, які каталізують перетворення субстрату через ланцюг послідовних реакцій, називається мультиферментним комплексом (мультиферментною системою). Метаболічні ферменти беруть участь у процесах дихання, росту, подразливості, скорочення м'язів тощо.
Травні ферменти — група ферментів, що розщеплює складні органічні сполуки та їх комплекси до простіших.
Ці ферменти в живій природі спостерігаються в лізосомах твариноподібних організмів, секреторних міхурцях грибів, травних секретах комахоїдних рослин, травній системі тварин. Травні ферменти належать до групи гідролаз, що каталізують реакції гідролізу.
 
Так, у травному тракті хребетних тварин і людини наявні:
  • протеази — ферменти, які каталізують розщеплення білків;
  • ліпази — ферменти розщеплення ліпідів;
  • амілази — ферменти рощеплення вуглеводів;
  • нуклеази — розщеплюють нуклеїнові кислоти до нуклеотидів.
Серед ферментів є і такі, які захищають від токсичних речовин (наприклад, антиоксидантні ферменти пероксидаза, каталаза та супероксиддисмутаза), від втрат крові (наприклад, ферменти зсідання крові — тромбін, фібрин).
 
Основним захисним ферментом багатьох організмів є лізоцим, який міститься в лейкоцитах, яєчному білку, шкірі, слизових оболонках і рідинах організму (слини, слізної рідини). Лізоцим розщеплює речовини, що є основою клітинної оболонки бактерій і захищає слизові оболонки ока, порожнини рота, кишечнику від інфекцій.
Роль ферментів полягає в забезпеченні метаболізму клітин, перетравлюванні складних речовин до простіших і забезпеченні захисту від несприятливих чинників.
Джерела:
Біологія і екологія (рівень стандарту): підруч. для 10 кл. закл. заг. серед. освіти / В. І. Соболь. – Кам’янець-Подільський : Абетка, 2018. с. 106.